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進(jìn)一步深化miRNA功能研究和水稻遺傳改良提供有效資源

DATE:2017-05-05    來源:齊一生物科技(上海)有限公司    點(diǎn)擊數(shù):

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PNAS雜志在線發(fā)表了中國科學(xué)院植物逆境生物學(xué)研究中心朱健康研究組的題為“Short tandem target mimic rice lines uncover functions of miRNAs in regulating important agronomic traits”的研究論文,該研究利用STTM技術(shù)大規(guī)模沉默水稻miRNA,并發(fā)現(xiàn)了多種miRNA的新功能,為進(jìn)一步深化miRNA功能研究和水稻遺傳改良提供了有效資源。
MicroRNA (miRNA)是一類在生物體內(nèi)普遍存在的非編碼、長度約 21個(gè)核苷酸的小分子RNA,它在調(diào)控植物的器官發(fā)育、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)和響應(yīng)逆境脅迫過程中起著重要作用。由于miRNA基因較小,且大多數(shù)miRNA家族都有多個(gè)成員組成,具有遺傳冗余性,所以很難通過傳統(tǒng)的基因功能缺失突變體的方式來研究miRNA的功能。目前對(duì)miRNA的研究主要通過過量表達(dá)miRNA或過量表達(dá)miRNA抗性靶基因(miRNA-resistant)。但miRNA一般調(diào)控多個(gè)靶基因,這些方法只能部分反應(yīng)miRNA的功能。 近來發(fā)明的靶標(biāo)模擬技術(shù),例如靶標(biāo)模擬(target mimic,TM)和短串聯(lián)靶標(biāo)模擬(short tandem targets mimic,STTM),可以有效的阻礙內(nèi)源miRNA的活性,這使得從基因組水平大規(guī)模研究miRNA功能成為可能。
該工作利用STTM技術(shù)降低了35個(gè)水稻重要miRNA家族的表達(dá)水平,發(fā)現(xiàn)了水稻許多miRNA調(diào)控農(nóng)藝性狀的新功能,同時(shí)驗(yàn)證了miRNA也可以作為作物改良的重要靶標(biāo)。在STTM-miRNA水稻株系中,發(fā)現(xiàn)miRNA參與調(diào)控了水稻株高、分蘗數(shù)、穗粒數(shù)等眾多重要的農(nóng)藝性狀,且這種受調(diào)控的表型可在連續(xù)5代中穩(wěn)定遺傳。通過這種方法,我們發(fā)現(xiàn)了多數(shù)miRNA具有一些重要的新功能,比如miR172具有影響莖的發(fā)育和穗的密度、miR156具有影響根發(fā)育的新功能。同時(shí),通過對(duì)miRNA的遺傳調(diào)控,證明了miRNA可以作為作物改良的重要靶標(biāo)。比如通過調(diào)控miRNA398的表達(dá)水平,可以提高水稻的穗長,穗粒數(shù)和穗長等,進(jìn)而提高水稻的產(chǎn)量。

該工作不但擴(kuò)展了我們對(duì)水稻中miRNA功能的認(rèn)識(shí),也為進(jìn)一步研究水稻miRNA功能和水稻品種改良提供了寶貴的資源;而且水稻中miRNA的功能也能很好的擴(kuò)展到其它重要農(nóng)作物中。

該工作得到了中國科學(xué)院等經(jīng)費(fèi)的支持。



利用STTM技術(shù)研究水稻miRNA發(fā)現(xiàn)其在調(diào)控許多重要農(nóng)藝性狀的重要功能

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