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研究表明DNA的動態(tài)排列在打開和關閉不同基因中有重要作用-齊一生物

DATE:2016-08-20    來源:齊一生物科技(上海)有限公司    點擊數(shù):


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在顯微鏡下觀察細胞核,圖中粉紅色的是染色體,綠色是核膜。左圖是X染色體移動前的圖像,右圖是X染色體連接到核膜后的圖像,這是X染色體沉默過程中的關鍵步驟。Xist分子首先跟X染色體結合,再與被稱為核纖層蛋白B受體(lamin b receptor)的核包膜蛋白(nuclear envelope protein)結合,X染色體進而被拉到細胞核邊緣。 圖片來源:加州理工學院 

男性只有一條X染色體,而女性有兩條X染色體,這意味著女性體內(nèi)由X染色體編譯產(chǎn)生的蛋白是男性的兩倍。人體內(nèi)某些蛋白質(zhì)如果過多將是致命的,所以在女性胚胎的早期發(fā)育過程中,所有細胞中的一個X染色體都會被沉默。 

一篇最近發(fā)表在《科學》雜志上的文章,第一次強調(diào)了細胞核中DNA三維結構的改變是X染色體沉默(也稱為X染色體失活)的關鍵步驟。研究表明,Xist單分子負責DNA重構,而這些變化導致了染色體沉默。 

該研究的領導者,生物學加州理工學院米切爾·格特曼(Mitchell Guttman)助理教授說:這就像是先有雞還是先有蛋問題一樣,我們雖然知道X染色體失活的過程中發(fā)生了DNA結構的變化,但我們不知道是這些變化導致了X染色體沉默還是X染色體沉默造成了這些變化。我們的研究結果表明,DNA的動態(tài)排列在打開和關閉不同基因中有重要作用。 

該研究是一個國際合作項目的一部分,研究的目的是為了更好地理解DNA在細胞核中如何形成一個三維結構,以及這種結構改變與基因的沉默和激活之間的關系。DNA鏈上的不同基因,在不同細胞中開啟或者關閉。當基因開啟時,他們將會指導產(chǎn)生相應的蛋白質(zhì)。DNA的形狀及折疊形式控制著這個過程,但是具體的細節(jié)仍未研究清楚。最近,美國國立衛(wèi)生研究院資助的4D Nucleome計劃(第四維是時間),旨在解決DNA結構這個秘密及其在各種人類疾病,如癌癥和過早老化疾病中作用。

 

圖解Xist分子如何編排X染色體沉默。在細胞核中,Xist分子與DNA鏈結合時會沉默少部分基因。當Xist分子與被稱為核纖層蛋白B受體的核包膜蛋白結合后,DNA被拉扯到細胞核的邊緣,這會導致DNA重塑其形狀,Xist獲得訪問X染色體中其他基因的權限,進一步實現(xiàn)基因沉默。 圖片來源:加州理工學院 

在這項新研究中,研究人員專注于Xist分子,其屬于長鏈非編碼核糖核酸(lncRNAs),是一種已知的對X染色體有沉默作用的分子。傳統(tǒng)RNA分子被認為是細胞中信息傳遞的介質(zhì),為產(chǎn)生蛋白質(zhì)提供模板,而lncRNAsXist分子可以直接與DNA結合,以開啟和關閉基因。在過去十年中,已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了數(shù)以萬計的lncRNAs。 

以前的研究已經(jīng)表明,Xist分子沿著DNA鏈與所有沉默X染色體結合,而不結合到活性X染色體上。研究人員表示,在細胞中,DNA三維結構和位置的變化都與染色體沉默有關。但對于Xist分子是否影響以及如何影響DNA結構變化,目前還不清楚。 

這項新研究概述了Xist分子沉默染色體的過程,并介紹了一個關鍵物質(zhì):核纖層蛋白B受體蛋白,這種受體蛋白位于細胞核膜上。 

我們的工作表明,Xist分子通過與核纖層蛋白B受體直接相互作用,使得X染色體移動到核膜,導致了DNA三維結構發(fā)生變化,陳春闞(格特曼實驗室的研究生和文章的主要作者)說。 

這個過程使Xist分子擴散到整個X染色體,使染色體大范圍被沉默,這在胚 胎發(fā)育過程中有重要的作用。” 

X染色體是用于研究DNA結構和基因沉默之間關系的良好模型,因為整個結構由一個RNA分子導致失活。然而,其他的染色體實驗更局部地研究基因沉默。古特曼和他的團隊正在計劃更多的研究來探測DNA的形狀改變和其他基因在細胞中的調(diào)控之間的關系。

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